אליפים מביא את סיפורם של תלמידי שכבת ט' בפנימייה החקלאית "גנות".

זו השנה הראשונה של התלמידים בפנימייה, השנה הראשונה בה הם מתנתקים מהבית, חיים ביחד עם נערים ונערות בני גילם וחווים אהבות, פחדים, התרגשויות ולחצים, כאשר במרכז העלילה עומדת מסורת ההתעללויות של תלמידי י"ב (הדלידים) כנגד הצעירים (האליפים) שמתאחדים כדי להשיב מלחמה. 

הדמות המרכזית בסדרה היא רוני - נער מתבגר שאיבד את אימו ועובר ללמוד בבית הספר החקלאי "גנות", שם הוא מקבל את הכינוי "אליף".

במסגרת המעבר לפנימייה נאלץ רוני להתמודד עם תלמידים גדולים ממנו, עם טקסי קבלה משונים אותם עוברים תלמידים חדשים, עם חברים חדשים וגם עם אהבות חדשות.

הספר אליפים נחשב לקלאסיקה ישראלית אהובה שבני נוער רבים גדלו עליה.