Date : Les mardi 18 mai et 8 juin 2010, 13h00
Lieu : M-625, Pavillon Roger-Gaudry
Durée : 3 heures par séance
Responsable : Jean-François Gariépy Veuillez confirmer votre présence: jeanfrancois.gariepy@gmail.com
Description
Cet atelier couvrira l'analyse d'images et la production d'animations avec vos données d'imagerie calcique, d'électrophysiologie, ou des vidéos enregistrés par caméra de comportements animaux. De plus nous apprendrons comment construire une interface graphique (GUI) permettant de travailler avec les images et les vidéos. L'atelier s'adresse autant à la personne qui n'a jamais été en contact avec Matlab qu'à celle qui connaît déjà très bien le programme mais qui désire perfectionner ses aptitudes en analyse d'images. Les gens qui possèdent déjà un ordinateur portable avec Matlab sont invités à l'amener, ce qui libérera des places pour les autres. Nous travaillerons soit par équipe de 2 ou 3 par ordinateur, ou seuls si il y a assez d'ordinateurs (nous avons 25 postes avec Matlab, il ne devrait donc pas y avoir de problèmes). Je présenterai les différentes fonctions pouvant être utilisées pour analyser des images et il y aura des exercices à faire pour vous familiariser avec ces fonctions tout au long de l'atelier.
Plan
Mardi 18 mai : Analyse d'images
- Introduction
- Interface Matlab
- Qu'est-ce qu'une image ?
- Images noir et blanc / images couleur
- Manipulations géométriques sur une image
- Interfaces graphiques: Comment ajouter des boutons à votre programme
- Extraire des données de l'image: optimisation du travail automatique et du travail manuel
Mardi 8 juin : Créer des vidéos à partir de vos données
- Introduction
- Principe du vidéo
- Illustration de formes géométriques sur vos images
- Suivre les mouvements d'une partie du corps d'un animal sur un vidéo
- Synchronisation des données brutes et de l'illustration des analyses
- Ajout de graphiques défilant (ex: données électrophysiologiques)
Documents
À venir
Liens utiles
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